recipe pyranges

GenomicRanges for Python.

Homepage:

http://github.com/endrebak/pyranges

License:

MIT / MIT

Recipe:

/pyranges/meta.yaml

package pyranges

Versions:

0.0.127-0,  0.0.125-0,  0.0.124-0,  0.0.120-0,  0.0.117-0,  0.0.115-0,  0.0.113-0,  0.0.112-0,  0.0.111-0, 

0.0.127-0,  0.0.125-0,  0.0.124-0,  0.0.120-0,  0.0.117-0,  0.0.115-0,  0.0.113-0,  0.0.112-0,  0.0.111-0,  0.0.110-0,  0.0.109-0,  0.0.108-0,  0.0.104-0,  0.0.103-0,  0.0.101-0,  0.0.100-0,  0.0.99-0,  0.0.98-0,  0.0.97-0,  0.0.96-0,  0.0.95-0,  0.0.94-0,  0.0.93-0,  0.0.92-0,  0.0.89-0,  0.0.88-0,  0.0.87-0,  0.0.86-0,  0.0.85-0,  0.0.84-0,  0.0.83-0,  0.0.81-0,  0.0.80-0,  0.0.79-1,  0.0.79-0,  0.0.78-0,  0.0.77-0,  0.0.76-0,  0.0.75-0,  0.0.74-0,  0.0.73-0,  0.0.72-0,  0.0.71-0,  0.0.70-0,  0.0.69-0,  0.0.67-0,  0.0.66-0,  0.0.65-0,  0.0.64-0,  0.0.63-0,  0.0.62-0,  0.0.61-0,  0.0.60-0,  0.0.59-0,  0.0.58-0,  0.0.57-0,  0.0.56-0,  0.0.55-0,  0.0.54-0,  0.0.53-0,  0.0.52-0,  0.0.51-1,  0.0.51-0,  0.0.50-0,  0.0.49-0,  0.0.48-0,  0.0.45-0,  0.0.44-0,  0.0.43-0,  0.0.42-0,  0.0.41-0,  0.0.40-0,  0.0.39-0

Depends:

• natsort

• ncls >=0.0.63

• pandas

• pyrle

• python

• sorted_nearest >=0.0.33

• tabulate

Required By:

• medicc2

• pyroe

• consplice

• pore-c

• methplotlib

• methylmap

• fuc

• bwread

• ananse

• kipoiseq

Installation

With an activated Bioconda channel (see set-up-channels), install with:

conda install pyranges

and update with:

conda update pyranges

or use the docker container:

docker pull quay.io/biocontainers/pyranges:<tag>

(see pyranges/tags for valid values for <tag>)

Download stats

Link to this page

Render an badge with the following MarkDown:

[![install with bioconda](https://img.shields.io/badge/install%20with-bioconda-brightgreen.svg?style=flat)](http://bioconda.github.io/recipes/pyranges/README.html)