recipe r-basejump

Base functions for bioinformatics and R package development.

Homepage:

https://r.acidgenomics.com/packages/basejump/

Developer docs:

https://github.com/acidgenomics/r-basejump

License:

GPL / AGPL-3.0

Recipe:

/r-basejump/meta.yaml

package r-basejump

Versions:

0.17.0-0,  0.16.5-1,  0.16.5-0,  0.16.4-1,  0.16.4-0,  0.16.3-0,  0.16.2-0,  0.16.1-1,  0.16.1-0, 

0.17.0-0,  0.16.5-1,  0.16.5-0,  0.16.4-1,  0.16.4-0,  0.16.3-0,  0.16.2-0,  0.16.1-1,  0.16.1-0,  0.15.0-0,  0.14.23-0,  0.14.22-0,  0.14.21-0,  0.14.20-0,  0.14.19-0,  0.14.18-0,  0.14.17-2,  0.14.17-1,  0.14.17-0,  0.13.4-0,  0.13.2-0,  0.12.16-0,  0.12.15-0,  0.12.14-0,  0.12.13-0,  0.12.10-0,  0.12.9-0,  0.12.8-1,  0.12.8-0,  0.12.7-0,  0.12.6-1,  0.12.6-0,  0.12.5-1,  0.12.5-0,  0.12.4-0,  0.12.3-0,  0.12.2-0,  0.12.1-0,  0.12.0-0,  0.11.23-0,  0.11.22-0,  0.11.21-0,  0.11.20-1,  0.11.20-0,  0.11.19-0,  0.11.18-0,  0.11.17-0,  0.11.16-0,  0.11.15-0,  0.11.14-0,  0.11.13-0,  0.11.12-0,  0.11.11-0,  0.11.10-0,  0.11.8-0,  0.11.7-0,  0.11.5-0,  0.10.9-1,  0.10.9-0,  0.9.11-0,  0.9.9-0,  0.7.2-1,  0.7.2-0,  0.5.9-0,  0.5.3-0,  0.1.1-0

Depends:

• bioconductor-singlecellexperiment

• bioconductor-summarizedexperiment

• r-acidbase

• r-acidexperiment

• r-acidgenomes

• r-acidmarkdown

• r-acidplots

• r-acidplyr

• r-acidsinglecell

• r-base >=4.2,<4.3.0a0

• r-magrittr

• r-pipette

• r-syntactic

Required By:

• r-acidgsea

• r-bcbiosinglecell

• r-deseqanalysis

• r-bcbiornaseq

Installation

With an activated Bioconda channel (see set-up-channels), install with:

conda install r-basejump

and update with:

conda update r-basejump

or use the docker container:

docker pull quay.io/biocontainers/r-basejump:<tag>

(see r-basejump/tags for valid values for <tag>)

Download stats

Link to this page

Render an badge with the following MarkDown:

[![install with bioconda](https://img.shields.io/badge/install%20with-bioconda-brightgreen.svg?style=flat)](http://bioconda.github.io/recipes/r-basejump/README.html)