recipe bcbio-nextgen-vm

Run bcbio-nextgen genomic sequencing analyses using isolated containers and virtual machines

Homepage

https://github.com/chapmanb/bcbio-nextgen-vm

License

MIT

Recipe

/bcbio-nextgen-vm/meta.yaml

package bcbio-nextgen-vm

(downloads) docker_bcbio-nextgen-vm

Versions

0.1.6-1, 0.1.6-0, 0.1.5-0, 0.1.3-1, 0.1.2a-1, 0.1.1-1, 0.1.1-0, 0.1.0a-136, 0.1.0a-135, 0.1.0a-134, 0.1.0a-133, 0.1.0a-132, 0.1.0a-131, 0.1.0a-130, 0.1.0a-129, 0.1.0a-128, 0.1.0a-127, 0.1.0a-126, 0.1.0a-125, 0.1.0a-124, 0.1.0a-123, 0.1.0a-122, 0.1.0a-121, 0.1.0a-120, 0.1.0a-119, 0.1.0a-118, 0.1.0a-117, 0.1.0a-116, 0.1.0a-115, 0.1.0a-114, 0.1.0a-113, 0.1.0a-112, 0.1.0a-111, 0.1.0a-110, 0.1.0a-109, 0.1.0a-108, 0.1.0a-107, 0.1.0a-106, 0.1.0a-105, 0.1.0a-104, 0.1.0a-103, 0.1.0a-102, 0.1.0a-101, 0.1.0a-100, 0.1.0a-99, 0.1.0a-98, 0.1.0a-97, 0.1.0a-96, 0.1.0a-95, 0.1.0a-94, 0.1.0a-93, 0.1.0a-92, 0.1.0a-91, 0.1.0a-90, 0.1.0a-89, 0.1.0a-88, 0.1.0a-87, 0.1.0a-86, 0.1.0a-85, 0.1.0a-84, 0.1.0a-83, 0.1.0a-82, 0.1.0a-81, 0.1.0a-80, 0.1.0a-79, 0.1.0a-78, 0.1.0a-77, 0.1.0a-76, 0.1.0a-75, 0.1.0a-74, 0.1.0a-73, 0.1.0a-72, 0.1.0a-71, 0.1.0a-70, 0.1.0a-69

Depends
Required By

Installation

With an activated Bioconda channel (see 2. Set up channels), install with:

conda install bcbio-nextgen-vm

and update with:

conda update bcbio-nextgen-vm

or use the docker container:

docker pull quay.io/biocontainers/bcbio-nextgen-vm:<tag>

(see bcbio-nextgen-vm/tags for valid values for <tag>)