recipe bcbio-nextgen-vm

Run bcbio-nextgen genomic sequencing analyses using isolated containers and virtual machines

Homepage

https://github.com/chapmanb/bcbio-nextgen-vm

License

MIT

Recipe

/bcbio-nextgen-vm/meta.yaml

package bcbio-nextgen-vm

(downloads) docker_bcbio-nextgen-vm

Versions
0.1.6-20.1.6-10.1.6-00.1.5-00.1.3-10.1.2a-10.1.1-10.1.1-00.1.0a-136

0.1.6-20.1.6-10.1.6-00.1.5-00.1.3-10.1.2a-10.1.1-10.1.1-00.1.0a-1360.1.0a-1350.1.0a-1340.1.0a-1330.1.0a-1320.1.0a-1310.1.0a-1300.1.0a-1290.1.0a-1280.1.0a-1270.1.0a-1260.1.0a-1250.1.0a-1240.1.0a-1230.1.0a-1220.1.0a-1210.1.0a-1200.1.0a-1190.1.0a-1180.1.0a-1170.1.0a-1160.1.0a-1150.1.0a-1140.1.0a-1130.1.0a-1120.1.0a-1110.1.0a-1100.1.0a-1090.1.0a-1080.1.0a-1070.1.0a-1060.1.0a-1050.1.0a-1040.1.0a-1030.1.0a-1020.1.0a-1010.1.0a-1000.1.0a-990.1.0a-980.1.0a-970.1.0a-960.1.0a-950.1.0a-940.1.0a-930.1.0a-920.1.0a-910.1.0a-900.1.0a-890.1.0a-880.1.0a-870.1.0a-860.1.0a-850.1.0a-840.1.0a-830.1.0a-820.1.0a-810.1.0a-800.1.0a-790.1.0a-780.1.0a-770.1.0a-760.1.0a-750.1.0a-740.1.0a-730.1.0a-720.1.0a-710.1.0a-700.1.0a-69

Depends
Required By

Installation

With an activated Bioconda channel (see 2. Set up channels), install with:

conda install bcbio-nextgen-vm

and update with:

conda update bcbio-nextgen-vm

or use the docker container:

docker pull quay.io/biocontainers/bcbio-nextgen-vm:<tag>

(see bcbio-nextgen-vm/tags for valid values for <tag>)