recipe nanoplot

Plotting suite for long read sequencing data and alignments

Homepage:

https://github.com/wdecoster/NanoPlot

License:

MIT / MIT

Recipe:

/nanoplot/meta.yaml

package nanoplot

Versions:

1.41.3-0,  1.41.0-0,  1.40.2-0,  1.40.0-0,  1.39.0-0,  1.38.1-0,  1.38.0-0,  1.37.0-0,  1.36.2-1, 

1.41.3-0,  1.41.0-0,  1.40.2-0,  1.40.0-0,  1.39.0-0,  1.38.1-0,  1.38.0-0,  1.37.0-0,  1.36.2-1,  1.36.2-0,  1.36.1-0,  1.35.5-0,  1.35.4-0,  1.32.1-0,  1.32.0-0,  1.31.0-0,  1.30.1-0,  1.30.0-0,  1.29.1-0,  1.29.0-0,  1.28.4-0,  1.28.2-0,  1.28.1-1,  1.28.1-0,  1.28.0-0,  1.27.0-0,  1.26.3-0,  1.26.2-0,  1.26.1-0,  1.25.1-0,  1.25.0-0,  1.24.0-0,  1.23.1-0,  1.20.0-1,  1.20.0-0,  1.19.0-0,  1.18.2-1,  1.13.0-1,  1.13.0-0,  1.11.0-0,  1.10.4-0,  1.8.1-0,  1.2.2-0,  1.1.0-0,  1.0.0-0,  0.16.4-0,  0.16.2-0

Depends:

• biopython

• libpng

• nanoget >=1.18.1

• nanomath >=1.0.0

• numpy >=1.16.5

• pandas >=1.1.0

• plotly >=5.4.0

• pyarrow

• pysam >0.10.0.0

• python >=3

• python-dateutil

• python-kaleido

• scipy

Required By:

• nanocomp

• bactopia-qc

Installation

With an activated Bioconda channel (see set-up-channels), install with:

conda install nanoplot

and update with:

conda update nanoplot

or use the docker container:

docker pull quay.io/biocontainers/nanoplot:<tag>

(see nanoplot/tags for valid values for <tag>)

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[![install with bioconda](https://img.shields.io/badge/install%20with-bioconda-brightgreen.svg?style=flat)](http://bioconda.github.io/recipes/nanoplot/README.html)