recipe intarna

Efficient RNA-RNA interaction prediction incorporating seeding and accessibility of interacting sites

Homepage:

https://github.com/BackofenLab/IntaRNA

License:

MIT

Recipe:

/intarna/meta.yaml

Links:

biotools: intarna, doi: 10.1093/nar/gkx279, doi: 10.1093/bioinformatics/btn544, doi: 10.1093/nar/gky329

package intarna

Versions:

3.3.1-0,  3.3.0.1-1,  3.3.0.1-0,  3.2.2-0,  3.2.0-0,  3.1.5-0,  3.1.3-0,  3.1.2-0,  3.1.1-0, 

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Depends:

• boost-cpp >=1.74.0,<1.74.1.0a0

• libgcc-ng >=10.3.0

• libstdcxx-ng >=10.3.0

• libzlib >=1.2.11,<1.3.0a0

• perl >=5.32.1,<5.33.0a0 *_perl5

• viennarna >=2.5.0,<2.6.0a0

• zlib >=1.2.11,<1.3.0a0

Required By:

• coprarna

• chira

Installation

With an activated Bioconda channel (see set-up-channels), install with:

conda install intarna

and update with:

conda update intarna

or use the docker container:

docker pull quay.io/biocontainers/intarna:<tag>

(see intarna/tags for valid values for <tag>)

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[![install with bioconda](https://img.shields.io/badge/install%20with-bioconda-brightgreen.svg?style=flat)](http://bioconda.github.io/recipes/intarna/README.html)