recipe meme

Motif-based sequence analysis tools

Homepage:

https://meme-suite.org

License:

Custom

Recipe:

/meme/meta.yaml

Links:

biotools: meme_suite, usegalaxy-eu: meme_dreme

package meme

Versions:

5.5.2-1,  5.5.2-0,  5.4.1-2,  5.4.1-1,  5.4.1-0,  5.3.0-2,  5.3.0-0,  5.1.1-3,  5.1.1-2, 

5.5.2-1,  5.5.2-0,  5.4.1-2,  5.4.1-1,  5.4.1-0,  5.3.0-2,  5.3.0-0,  5.1.1-3,  5.1.1-2,  5.1.1-1,  5.1.1-0,  5.1.0-0,  5.0.5-0,  5.0.2-5,  5.0.2-3,  5.0.2-2,  4.12.0-2,  4.12.0-1,  4.12.0-0,  4.11.2-8,  4.11.2-6,  4.11.2-5,  4.11.2-4,  4.11.2-3,  4.11.2-2,  4.11.2-1,  4.11.2-0,  4.11.1-7,  4.11.1-6,  4.11.1-5,  4.11.1-4,  4.11.1-3,  4.11.1-2,  4.11.1-1,  4.11.1-0,  4.8.1-3,  4.8.1-2,  4.8.1-1

Depends:

• expat

• ghostscript

• icu >=70.1,<71.0a0

• libexpat >=2.5.0,<3.0a0

• libgcc-ng >=12

• libxml2 >=2.10.3,<2.11.0a0

• libxslt >=1.1.37,<2.0a0

• libzlib >=1.2.13,<1.3.0a0

• openmpi >=4.1.5,<5.0a0

• perl >=5.32.1,<5.33.0a0 *_perl5

• perl-cgi

• perl-file-which

• perl-html-parser

• perl-html-template

• perl-html-tree

• perl-json

• perl-log-log4perl

• perl-math-cdf

• perl-module-build 0.4234.*

• perl-sys-info

• perl-xml-parser

• perl-xml-simple

• perl-yaml

• python >=3.10,<3.11.0a0

• python_abi 3.10.* *_cp310

• xz >=5.2.6,<6.0a0

• yaml >=0.2.5,<0.3.0a0

Required By:

• haystack_bio

• chexmix

• multigps

• rodeo

• gimmemotifs

• pureclip

• antismash

• antismash-lite

• sequnwinder

Installation

With an activated Bioconda channel (see set-up-channels), install with:

conda install meme

and update with:

conda update meme

or use the docker container:

docker pull quay.io/biocontainers/meme:<tag>

(see meme/tags for valid values for <tag>)

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[![install with bioconda](https://img.shields.io/badge/install%20with-bioconda-brightgreen.svg?style=flat)](http://bioconda.github.io/recipes/meme/README.html)