recipe pysradb

Python package for interacting with SRAdb and downloading datasets from SRA

Homepage

https://github.com/saketkc/pysradb

Documentation

https://saketkc.github.io/pysradb

License

BSD / BSD License

Recipe

/pysradb/meta.yaml

Links

biotools: pysradb, doi: 10.12688/f1000research.18676.1

Python package for interacting with SRAdb and downloading datasets from SRA

package pysradb

(downloads) docker_pysradb

Versions
0.11.1-00.11.0-00.10.4-00.10.2-00.10.1-00.10.0-00.9.9-00.9.7-00.9.6-0

0.11.1-00.11.0-00.10.4-00.10.2-00.10.1-00.10.0-00.9.9-00.9.7-00.9.6-00.9.0-00.8.0-00.7.1-00.6.0-00.4.2-00.4.0-00.3.0-00.2.2-0

Depends
Required By

Installation

With an activated Bioconda channel (see 2. Set up channels), install with:

conda install pysradb

and update with:

conda update pysradb

or use the docker container:

docker pull quay.io/biocontainers/pysradb:<tag>

(see pysradb/tags for valid values for <tag>)